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殿堂入り後のフローチャート

1.全国版図鑑を手に入れる

全国版のポケモン図鑑が入手できていない場合は、入手したい。
やり方は、ポケモン図鑑を60匹以上にして、マサラタウンのオーキド博士に話しかけること。
そうすると、ナナシマ地方のフィールドに、ジョウト地方のポケモンが出現するようになる。

2. 1のしま・ともしびやまの東側にある洞窟に向かう

ロケット団員2人を倒し、洞窟の奥へ進む。
（直前、後々に行く5のしまの倉庫の、パスワードのうち片方が聞こえる）
点字がたくさんある部屋があるが、それらの点字は50音表なので、無視。
最奥地で「ルビー」を手に入れた後、脱出。

3. 「ルビー」をニシキに渡す

1のしまのポケモンセンターへ行き、
ネットワークマシンのところにいるニシキにルビーを渡す。
「トライパス」が「レインボーパス」と入れ替わり、4～7のしまへ行けるようになる。

4. 4のしまに行く (3/6 修正)

4のしま北東部の「いてだきのどうくつ」で、「たきのぼり」を手に入れる。「たきのぼり」は、この場で水ポケモンに覚えさせる。
たきのぼりを使用し、洞窟の最奥地に行くと、カンナとともに、ロケット団員と強制戦闘。

5. 5のしまのロケット団員を倒す

5のしまは後回しにしてもよいのだが、フィールド上のロケット団員をここで全て倒しておくと、後々楽になる。
最奥地のロケット団倉庫に行くと、パスワードがもう片方、必要なことがわかる。

6. 6のしまでパスワードを入手する

続いて6のしまに行き、みずのさんぽみちを南方に進む。
そうすると、「いせきのたに」に到着する。
ここの攻略については別な攻略記事（こちら）にあるので、ここでは割愛する。

7. 5のしまのロケット団倉庫に突入する

5のしまに戻りロケット団倉庫の扉を調べると、ロックが解除されるので、突入する。
中に入ると、タマムシ基地と同じような、踏むと勝手に進むトラップがある。
しかも、タマムシに比べて入り組んでいるので注意すること。

奥地で女性幹部を撃退すると、移動床の構造が変わり、いったん外に出られるようになる。

その奥で男性幹部と研究員を倒すと、「サファイア」が手に入る。

8. ニシキに「サファイア」を渡す (3/6 追記)

1のしまのポケモンセンターへ行き、
ネットワークマシンのところにいるニシキにサファイアを渡す。
すると、ポケモン図鑑が全国版であれば、
ルビー・サファイアとの交換が可能になる。

9. そこから先は・・・ (4/6 追記)

そこから先は、基本的に自由行動になります。
これ以下では、その一例を示そうと思います。

例1: アスカナ遺跡 (4/6 追記)

７のしま到着後、南へ向かい、「しっぽうけいこく」にある洞窟に入ります。
そこで、「かいりき」を使って岩全てを穴に入れる。
そして、さらに南へ向かい、「アスカナいせき」にある洞窟へ行く。
→アンノーンが出現し、ゲットできる。

例2: ハナダシティ謎の洞窟 (4/6 追記) (4/15 更新)

ハナダシティ北部、２４番道路南西から波乗りをすると洞窟が見える。
そこの洞窟は、高レベルの野生ポケモンが大勢いるほか、
最奥地には、伝説のポケモン「ミュウツー」がいる。
ミュウツーは、レベル７０と非常に強力なので、マスターボールでの捕獲を推奨する。

詳しくは、以下のドキュメントを参照。
・ハナダシティ謎の洞窟入手アイテム (作成中)

例3: セキエイ高原に行って強化版リーグに挑む (4/28 追記)

セキエイ高原では、ポケモンリーグに何度でも挑戦できますが、
ここまでのイベントをこなすと、ポケモンリーグで四天王が出すポケモンが強化されます。
レベルは63～75程度。詳細はこちら。

例4: トレーナータワーに挑戦する

ポケモンのレベルが上がったら、トレーナータワーでタイムアタックに挑戦しよう。
どこまで早く倒せるかな？

トレーナータワー攻略（１）位置とルール編